2006年中国B2B电子商务行业保持了与2005年相当的发展速度，市场较为活跃，仍处在寡头垄断的态势下。综合平台以阿里巴巴、慧聪网、环球资源为代表的第一阵营仍旧占据着B2B电子商务市场的绝大部分市场份额。第二阵营中买麦网、沱沱网、中国供应商、金银岛、中国制造网、铭万网、万国商业网等都以差异化的服务和资源优势在各自市场上耕耘。行业联盟平台模式的平台希望通过多方资源共享来挤占第二阵营市场。许多行业垂直型电子商务平台也做得非常优秀，如中国化工网、我的钢铁网等。
艾瑞市场咨询认为，B2B电子商务第一阵营在一段时期内仍将维持阿里巴巴一家独大的情况，慧聪网和环球资源的合作会对这一阵营造成一定的影响，仍难以撼动阿里巴巴的领先地位。
第二阵营B2B电子商务平台在短期内不面临生存问题，部分企业在盈利方面还面对挑战。从长期发展来看，找到与第一阵营公司之间的差异化定位，专注于在某项领域或服务领先，将是第二阵营公司成功的关键。行业联盟式B2B电子商务平台存在很多难以解决的问题，如自身联盟成员合作关系较为松散，联盟内部成员之间存在竞争关系，而且利益很难分配等等。
垂直行业B2B电子平台大多都具有在传统行业服务的经验、人才和资源。中国化工网、中国服装网、全球五金网、建材第一网等行业垂直类B2B电子商务企业在各自行业和领域逐渐成为主导行业态势的电子商务平台。许多以线下服务为主的传统行业公司都有可能利用自身的资源，为已有客户提供电子商务服务，转型为B2B电子商务服务商。行业垂直电子商务的发展模式逐渐成为电子商务发展的主导模式之一。