字节跳动在生物计算领域投下一枚重磅“炸弹”——正式推出全开源生物分子结构预测模型Protenix-v1。该模型不仅完整复现了AlphaFold3（AF3）的核心功能，更通过Apache2.0协议全面开放代码与模型参数，为全球科研人员打开顶尖生物大模型的技术大门，推动行业进入开放协作的新阶段。
Protenix-v1的核心突破在于其全原子3D结构预测能力。该模型可同时处理蛋白质、核酸（DNA与RNA）及小分子配体等复杂生物系统，实现从单一分子到多组分交互的高精度建模。据第三方评测平台AIbase披露，在相同训练数据规模、模型参数量及计算资源条件下，Protenix-v1在多项基准测试中表现优于AlphaFold3，成为全球首个达到这一水平的全开源模型。
为确保评估的客观性与可复现性，字节跳动同步发布PXMeter v1.0.0评测工具箱。该工具箱包含超过6000个高难度分子样本，覆盖蛋白质折叠、核酸-配体结合等关键场景，为行业提供标准化测试基准。项目团队还开发了基于浏览器的交互式Web服务器，科研人员无需本地部署即可在线运行模型、可视化预测结果，大幅降低技术使用门槛。
业内专家指出，Protenix-v1的开源将重塑生物计算领域的研究范式。传统药物研发中，分子结构预测需耗费数月时间与高额成本，而该模型的开放将使全球实验室快速验证假设、优化设计方案。在合成生物学领域，研究人员可基于模型预测设计新型酶或代谢通路，加速从实验室到产业化的转化进程。这一突破或成为推动生命科学基础研究与应用开发的关键引擎。
